蛋白质修饰:蛋白质结构预测的背景及生物学意义

目前,蛋白质序列数据库的数据积累的速度非常快,但是已知结构的蛋白质相对比较少.尽管蛋白质结构测定技术有了较为显著的进展,但是通过实验方法确定蛋白质结构的过程仍然非常复杂,代价较高,因此实验测定的蛋白质结构比已知的蛋白质序列要少得多.另一方面,随着 DNA 测序技术的发展,人类基因组及更多的模式生物基因组已被或将被完全测序,DNA序列数量将会急增,而由于DNA序列分析技术和基因识别方法的进步,我们可以从DNA推倒导出大量的蛋白质序列.这意味着已知序列的蛋白质数量和已测定结构的蛋白质数量(如蛋白质结构数据库P...

Native-PAGE:Native-page技术

1. 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的过程中,蛋白质的迁移率不仅和蛋白质的等电点有关,还和蛋白质的量以及形状有关,其中蛋白质的等电点是最重要...

蛋白质含量测定:植物体内可溶性蛋白质含量的测定(LoWry法与劳里法)

  双缩脲(NH2-CO-NH-CO-NH2)在碱性溶液中可与铜离子产生紫红色的络合物,这一反应称为双缩脲反应.因为蛋白质中有多个肽键,也能与铜离子发生双缩脲反应,且颜色深浅与蛋白质的含量的关系在一定范围内符合比尔定律,而与蛋白质的氨基酸组成及量无关,所以可用双缩脲法测定蛋白质的含量....

SDS-PAGE:聚丙烯酰胺凝胶电泳PAGE胶的配制

5、 立即插入适当的梳子,密切注意防止梳齿下产生气泡,用一有力的夹将梳子夹在一边的玻璃板上,然后将玻璃板斜靠在物体上,使成10°角,可减少液体泄漏的机会....

俄以科学家找到恢复蛋白质活性的方法

  蛋白质特别是酶,可以加快化学反应的速度,所以被广泛用于药品和食品工业。蛋白质拥有复杂的空间结构,且其空间结构与蛋白质的功能直接相关,如果其空间结构被,则蛋白质失去活性。一个常见的例子是鸡蛋蛋清在加热后凝结成不透明状。在生产酶的过程中,约80%的制成酶由于蛋白质会变性而失去活性,所以工业生产中急需找到能恢复蛋白质活性的办法。2015年,美国化学家在实验室条件下成功恢复了受热变性的鸡蛋蛋白,但至今,科学家们未找到有效的工业条件下恢复变性蛋白的方法。...

2D电泳技术:二维聚丙烯酰胺凝胶电泳原理介绍

通常第一维电泳是等电聚焦,在细管中(φ1~3 mm)中加入含有两性电解质、8M的脲以及非离子型去污剂的聚丙烯酰胺凝胶进行等电聚焦,变性的蛋白质根据其等电点的不同进行分离.而后将凝胶从管中取出,用含有SDS的缓冲液处理30 min,使SDS与蛋白质充分结合....

蛋白质修饰:蛋白质二级结构预测-最邻近方法

基于上述的策略,最邻近方法在预测二级结构方面包括两个过程,一是学习过程,二是预测过程.在学习阶段,用一个滑动窗口(例如长度为15)扫描已知结构的训练序列,序列个数为几百个,并且这些序列彼此之间的相似性很小.通过窗口扫描形成大量的短片段(称为训练片段),记录这些片段中心 氨基酸残基的二级结构.在预测阶段,利用同样大小的窗口扫描给定的序列U,将在每一个窗口下的序列片段U’与上述训练片段相比较,找出50个最相似的训练片段.假设这些相似片段中心残基各种二级结构的出现频率分别为fα、f&be...

蛋白质含量测定:酶活性分析法检定蛋白质

a. 以上步骤,只可测定GUS 活性的相对大小,对色析法所得到的各个分划进行侦测,相当方便,但并非酶绝对活性单位的测定方法....

蛋白质含量测定:离子交换色谱

  离子交换剂是在载体上键合了一些离子交换基团,而离子交换基团在水溶液中通过电离出游离的离子,这些离子可带正电或带负电,可以被溶液中的其它带相同电荷的离子取代,并对离子交换剂有较强的结合力。结合力的大小不仅受离子与离子交换剂之间作用力的影响,而且主要受离子浓度的影响,这个过程中的作用力是静电引力,离子交换的原理是静电相互作用。...

SDS-PAGE:考马斯亮蓝蛋白胶快速染色液常见问题

溶液的pH值决定带电颗粒的解离程度.也决定物质所带净电荷的多少.对氨基酸、蛋白质等两性电解质而言,溶液PH值离等电点越远,颗粒所带净电荷越多,电泳速度越快.反之越慢.血清中:白蛋白pI 4.0;α2球蛋白 pI 5.06;β球蛋白 pI 5.1;γ球蛋白 pI 7.1.在pH 8.6的缓冲液中电泳时,都带负电荷,其泳动速度为:白蛋白>α2球蛋白>β球蛋白>γ球蛋白.为了利于分离蛋白质混合液,应选择一种使各种蛋白质所带电荷...

SDS-PAGE:SDS-PAGE的影响因素

溶液的pH值决定带电颗粒的解离程度.也决定物质所带净电荷的多少.对氨基酸、蛋白质等两性电解质而言,溶液PH值离等电点越远,颗粒所带净电荷越多,电泳速度越快.反之越慢.血清中:白蛋白pI 4.0;α2球蛋白 pI 5.06;β球蛋白 pI 5.1;γ球蛋白 pI 7.1.在pH 8.6的缓冲液中电泳时,都带负电荷,其泳动速度为:白蛋白>α2球蛋白>β球蛋白>γ球蛋白.为了利于分离蛋白质混合液,应选择一种使各种蛋白质所带电荷...

蛋白质修饰:蛋白质结构的预测软件

  蛋白质三维结构的预测方法通常包括:同源性建模和从头开始的预测方法.对数据库中已知结构的序列的比对是预测未知序列结构的主要方法,也即同源建模的方法....

蛋白质含量测定:HPLC测定乳糖酸红霉素的含量

乳糖酸红霉素是红霉素的乳糖醛酸盐,主要抗菌活性为乳糖酸红霉素A和含有一定活性的乳糖酸红霉素B、C .《中国药典2000年版采用微生物检定法进行含量测定 ,英国药典和欧洲药典均采用HPLC .鉴于微生物检定法影响因素较多,故采用高效液相色谱测定乳糖酸红霉素含量的方法....

SDS-PAGE:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法

2、将配制好的分离胶加入制胶槽中,注意应沿着边缘缓慢加入,千万别进气泡. 凝胶液加至约距前玻璃板顶端1.5CM或距梳子齿约0.5CM处....

蛋白质含量测定:蛋白质含量测定(考马斯亮蓝 G - 250 法)

考马斯亮蓝 G - 250 是一种染料,在游离状态下呈红色,当它与蛋自质结合后变为青色.蛋白质含量在 0 - 1000ug 范围内,蛋白质一色素结合物在 595 nm 下的吸光度与蛋自质含量成正比,故可用比色法测定....